@eido זה נקרא אבטחה באמצעות הסתרה וכדאי להתרגל להימנע מזה באופן גורף כי בדרך כלל התועלת קטנה והנזק גדול שיש תחושת שווא של אבטחה ולא דואגים לאבטחה אמיתית
לדוגמה הזרקת SQL לא מגנים על ידי יצירת שכבות מלאכותיות אלא על ידי Prepared Statements (כמו שעשית) ואז אין עניין בכל השלבים (לא מבין מה אתה מתכוון רגל בפנים בגלל שיודעים את שם הקובץ)
וגם הסתרה של שם קובץ זה לא הגנה, צריך להוציא אותו ממיקום שבו השרת אינטרנט מריץ או לחסום בקובץ .htaccess
ולגבי השאלה המקורית - מקובל לעשות להיפך, לעשות את הולידציה בנקודת הכניסה של הנתונים ולשמור את קוד העדכון עצמו נקי. בכל מקרה אין עניין לעשות אותה בדיקה בשתי מקומות בקוד
